Ich kenne Illustrator leider nicht, aber wenn die Pfade mit dem was der Plotter macht übereinstimmen, dann sind da noch informationen drin, die an den Plotter gesendet werden.
Und da der Plotter einer ist der nicht mitdenkt, sonder brav das tut was man Ihm sagt, macht er dann auch diese Pfade.
Wie Du diese jetzt aber wieder los wirst, da bin ich leider überfragt.